十八届三中全会提出设立国家安全委员会。设立国家安全委员会既是针对我国面临的外部安全和内部安全形势和任务作出的战略部署，也是世界上一些主要国家的共同选择。国家安全委员会设立后将搭建一个统筹国家安全工作的综合管理平台，标志着我国建立了一元化的国家综合安全管理的最高领导机构，将对我国的政府应急管理工作产生方向性、全局性和战略性的影响，也为解决当前政府应急管理理念、法制、体制、机制、应急队伍、资源管理等一系列突出问题和薄弱环节创造了契机。必须看到，在设立国家安全委员会后，要把政府应急管理工作纳入到新的国家综合安全管理框架下来重新考量和统筹规划。具体来看，当前及今后一段时间我国的政府应急管理工作在以下方面亟待调整和加强。
把政府应急管理组织体系纳入新国家安全管理体制框架内。近些年，美、日、俄、英、法等国都把加强和完善综合国家安全的顶层设计作为提升政府应急管理能力的重要突破口，构建权威高效、平灾结合、平战结合、职责明晰的应急管理组织体系成为这些国家应急管理体制改革的最显著特征。目前，我国在省级政府层面基本都成立了应急管理的领导机构，但是在中央层面并没有真正明确日常性的应急管理综合决策机构，这已难以适应越来越常态化的重特大突发事件的处置需要，同时导致对地方政府应急管理的指导和督查工作较难开展。另外，从国防动员委员会、国家防汛抗旱总指挥部、国家减灾委员会、国务院安全生产委员会、国家防震抗灾委员会、国家森林防火指挥部、国家反恐怖工作领导小组等诸多相关机构的实际工作情况来看，议事协调机构过多、过杂，部分职责交叉、重叠且权威性不足。应在国家安全委员会框架下，设立综合化的应急管理最高决策机构；同时，研究和探索在国家安全委员会办事机构的框架下，设置多个（最好为3~7个）秘书处（或其他名称的办事机构）的架构，现有的中央政府应急管理办事机构可以作为其一个秘书处（或其他名称的办事机构），或是直接作为国家安全委员会办事机构的一个内设机构，以增强应急管理工作协调的全面性、权威性和效率化。另外，还应注意加快推进和完善现有国防动员、安全生产监管、消防管理、灾害救助、海外人道主义援助、公务员培训等其他相关体制的改革，确保在设立国家安全委员会后，进一步促进政府应急管理决策、执行和监督工作的不断优化，促进政府应急管理能力的整体提升。
加快推进平灾结合、平战结合的应急管理标准化建设。当前，加快推进在新国家安全工作格局下应急管理标准化建设十分紧迫。注意推进突发事件预防和准备、处置和救援等各阶段工作的规范化和标准化建设，以及应急物资和装备、现场指挥和控制、辅助部门和支持设备等具体领域的标准化建设工作。注意研究资源管理的标准化，应急装备的制式化、系列化和兼容性，组织管理机构的标准化等问题。同时，统筹考量军事作战、国防动员、应急管理等体系的标准化问题，重点加强在突发事件应对中的指挥系统、资源保障、现场控制、应急标识、作图作业等方面的标准化。具体来看，一是建立平战结合、平灾结合的、共通的、一元化的突发事件现场指挥体系，建立该体系，可以有效降低由于指挥架构不清楚、术语不统一、通讯频率不协调、支持需求不明确等方面出现的问题；二是促进平灾结合、平战结合的资源管理标准化，比如，人力资源、综合物资保障、装备配备、运输途径、资源标识、灾民生活救助等方面标准；三是加快推进突发事件现场控制的标准化，比如，突发事件现场警戒线的划设、资源集结地点、人员疏散、现场恢复和整理等标准。
加强平灾结合、平战结合的应急管理队伍建设。目前，我国军队已组建抗洪抢险应急部队、地震灾害紧急救援队、核生化应急救援队、空中紧急运输服务队、交通电力应急抢险队、海上应急搜救队、应急机动通信保障队、医疗防疫救援队、气象保障应急专业队等九类5万人的国家级应急专业力量，同时，各军区会同有关省（自治区、直辖市），依托现役和预备役部队组建了4.5万人的省级应急专业力量。在充分发挥应急组织机构和专业队伍一专多能的基础上，继续加强以公安消防队伍为依托的综合应急救援队伍建设，加快改革和完善应急队伍管理制度，推进消防力量的专业化、职业化和综合化。在新国家安全框架下，统筹非战争军事行动力量和政府应急队伍建设。研究和探索民兵应急队伍建设的有效途径，加快完善相关的培训制度、资格认证、装备建设、资金支持等方面的制度建设，促进民兵应急队伍有序参与应急工作。同时，加快探索适合中国国情的平灾结合、平战结合的应急管理志愿者队伍建设。
加快推进平灾结合、平战结合的资源保障体系建设。研究和探索把军队作战、国防动员等体系资源纳入国家应急管理体系的有效途径，促进各类资源平灾结合、平战结合的共享集约化水平，全方位提高应急资源的快速投送和保障能力。建立军地之间、跨部门之间可以共享的应急资源信息库，对国防动员、应急管理等领域的资源进行梳理和分类、信息汇总，建立台账，动态管理。研究探索平灾结合、平战结合的应急物资储备与生产能力储备相结合的储备管理模式，加快编制平灾结合、平战结合共通的应急物资产品目录。在综合国家安全风险评估的基础上，结合应急管理和军事斗争的双重需要，加快推进共享集约、快速高效的国家综合安全保障体系建设。
建立新国家安全框架下的应急管理培训和演练制度。在国家安全委员会设立后，应建立国家安全委员会指导下，以国家级应急管理培训基地为平台的国防、应急管理、警务、消防、外事等中央层级培训机构参与的综合国家安全教学培训协作制度，加强对应急培训工作的统一领导，研究和统筹规划全国范围的、军地协同的应急管理培训工作，编制国家应急管理培训规划。在新国家安全框架下，加快探索建立应急管理教学培训与应急管理岗位实际技能需求相对应、教学培训和及时总结改进应急管理工作相结合、应对政府应急管理问题和综合国家安全问题相衔接的新型的公务员教学培训工作制度。当前，如何有效处置跨区域、军地协同的重特大突发事件是重大课题。充分借鉴国内外的相关经验，结合国家非战争军事行动能力建设、国防动员、应急管理等工作的实际特点，建立和完善国家层级应急管理定期演习制度，开展跨区域、军地协同的综合性演习。
总的来说，面对综合国家安全问题的挑战，要以设立国家安全委员会为契机，更有效地整合现有军队、国防动员、外交、公安、应急管理等方面资源，利用好各相关存量资源，建设好增量应急资源，加快开发、建设和完善国家应急资源管理、情报分析、快速决策能力的支持工具，加快推动应急资源统筹管理、信息和情报的战略研判、快速反应和应急决策等工作的科学化、标准化和精确化，提高复杂情势下的应急决策能力、军地和各层级间的应急协调和合作能力，及时确认和妥善应对国际国内安全中的优先性问题。同时，要加快完善和理顺在新国家安全框架下的非战争军事行动、国防动员、应急管理等方面的体制机制，促进在突发事件应对中的事前、事中、事后的相互衔接和协作，从而加快提升我国的综合国家安全管理能力。
