1997年7月，东南亚国家爆发了金融危机。同年7月2日，泰国宣布放弃实行13年的固定汇率制，泰铢因此大幅度贬值，导致了其他国家货币的迅速贬值，从而引发了严重的金融危机。此次金融危机以货币、银行、债务以及信用等危机交织并发为特征，并引发了某些国家的政局波动和社会动荡。东南亚金融危机中断了各国经济持续高速增长的进程，此后经济出现了急剧波动。1998年各国经济普遍陷入严重衰退，1999年和2000年却出现快速复苏或强劲反弹，而到2001年多数国家经济又急转直下，甚至出现负增长。2002年以后，东南亚经济逐渐呈现复苏的态势，泰国、印尼提前还清国际货币基金组织的贷款，各国经济基本走出了金融危机的阴影。这一时期，东南亚国家积极实施国内经济重组与调整。1997年金融危机爆发后，各国先是被迫采取经济紧缩政策，到1998年9月起开始普遍转向实施扩张性的宏观经济政策，促进国内经济的复苏；各国继续实施传统产业的技术升级，大力发展新兴产业，并启动一些大型基础设施建设项目，以加快国内产业结构的调整与升级；各国政府加快了国内金融机构的重组，实施银行金融机构的合并，积极处理不良金融资产。
2008年起，在国际金融危机的冲击下，东南亚经济普遍出现衰退或减速。全球金融市场的持续波动，使得东南亚的汇市和股市急剧下挫，外国资本大量撤离，印尼盾与美元的比值曾跌至三年来的新低，菲律宾比索汇率创下一年半来的新低，新元汇率也降至2007年以来的最低点，越南股市市值跌幅高达58%，新加坡下跌47.5%，马来西亚也跌去约40%（IMF，2010）。随着国际金融危机向实体经济冲击的扩展，金融危机对于高度外向型的东南亚经济的影响逐渐显现。各国出口贸易急剧下降，企业生产订单减少，银行信贷大幅紧缩，房地产市场陷入低迷，失业人数开始增加。2009年，文莱、柬埔寨、马来西亚、新加坡和泰国经济均出现负增长。为应对国际金融危机，东南亚国家实施了扩大内需和刺激经济的政策，以稳定国内经济。2010年，各国经济相继从衰退中复苏，经济增长加速，出口贸易回升，外资大量流入。在此次国际金融危机中，印尼是东南亚国家中受危机冲击较小的国家之一。2010年，菲律宾的经济增长率创下二十四年来的新高，新加坡的该年度经济增长速度也是建国以来最快的一年。但是，国内经济快速增长和大量热钱流入，一些国家物价上升，货币升值，股票价格上涨，房地产迅速回升，资产泡沫逐渐形成。2011年，东南亚国家仍保持了经济持续复苏的态势，但随着下半年全球经济形势的动荡，欧元区主权债务危机的蔓延，世界经济增长趋于放缓，东南亚主要国家的经济增长也呈现出减缓的迹象（王勤，2012）。
总之，近几十年来，东南亚经历了战后初期的经济恢复、20世纪60—70年代工业化发展、80年代中期至90年代中期经济高速增长、后起国家的经济开放与改革、90年代后期金融危机及其重组等几个重要时期。当前，东南亚经济已成为世界经济增长的热点地区，新加坡率先成为新兴工业化国家，马来西亚、泰国等已处于工业化的中期阶段，后起国家仍处于工业化的初期阶段。
