随着中国市场化改革的推进，探索公有制在市场经济条件下合理有效、多样性的实现形式，就成为国有企业改革的历史使命，也成为国有企业改革的目标规定性。这种实现形式来自经济基础的内在要求，是公有制微观主体的内在利益要求的实现形式，而不由政府行政权力强力维护和支配。同时这种实现形式又能够与市场经济体制相吻合，能够在市场经济体制下存在、运行、发展。社会主义市场经济体制作为我国基本经济体制，决定了国有企业改革的具体制度选择，就是构建与市场经济体制相适应的现代企业制度，实现公有制经济与市场经济体制的有机融合。由此决定了国有企业改革的目标模式是公有制在市场经济条件下的实现形式，即拥有国有资产股权、股份的公司制现代企业制度。
以建立和完善现代企业制度为国有企业改革的目标模式，在内在逻辑上要完成几个环节的转换。首先是把公有制财产转换为可以在市场经济体制下运行的资产、资本的形式，形成国有资产、国有资本；进而把国有资产、国有资本明确量化，形成可以自主流转、自由组合的微观权利单元；这些权利单元形成投资者可以购买或转让、市场上可以估价及流转的股份；这些股份自主组合成股份制公司，形成市场经济体制下可以追求自身经济利益的微观主体；这些微观主体具有了追求资产保值增值、追求资本收益最大化的内在利益动力；公有制经济具有了适应市场经济体制运行要求、不依赖于政府行政权力强力维持、富有内在利益驱动的微观实现主体及其实现形式；公有制经济实现市场化运行要求，公有制的经济基础成为真正的经济基础。
以现代企业制度作为国有企业改革的目标模式，就是以公司制为主要实现形式来实现公有制经济在市场经济体制下存在、运行、发展壮大的基本经济制度要求。
当前及今后国有企业改革的重心是深化运行模式的改革。明确了国有企业改革的目标要求就是实现公有制经济的市场化运行，也明确了国有企业改革的目标模式是建立和完善现代企业制度。目标模式是一个静态的规定性，而在日常的经济运行中，国有企业改革还需要解决动态的运行模式问题，即解决公有制经济市场化运行的具体操作问题。也就是说，在国企改革的初期，在逻辑上，我们首先要明确国企为什么要改革，改成什么样，这是目标模式要解决的问题。而在明确了国企改革的目标模式之后，我们需要解决的就是怎样使得国有企业真正按照现代企业制度的组织框架和规则体现，有效地运行起来。因此，深化国有企业的改革，不是在目标模式上继续争论或陷入动摇，而是要在具体运行模式上深入探索，使得现代企业制度的内在要求，真正外化成为企业的运行机制、运行行为。
运行模式的改革侧重的是企业行为的改革。国有企业改革的目标模式解决的是改革的基本制度规定性问题。国有企业改革的运行模式，则是着眼于解决企业的行为问题。制度就是行为规则，制度的基本构成包括两个大的基本方面，一是行为规则的基本规定，一是行为规则的实施机制。如果说改革的目标模式确定的是行为规则的基本规定性，那么改革的运行模式则确定的是行为规则的具体的实施机制。国有企业改革的目标模式，是由我国的基本经济制度和基本经济体制所决定的，它确定了国企改革不可违背的基本制度规定性，确定了国企改革基本的行为规则。但行为规则的明确不等于行为规则的落地，要想让所规定的行为规则真正在企业的行为中得到体现、遵守、实施，就必须构建相应的实施机制，即构建使得行为规则真正落地的运行模式。如果说国企改革的目标模式指明了改革的根本方向，那么国企改革的运行模式则是改革方向、改革目的的实现路径。
